预报台在闽江口以南海域设有平潭、崇武、厦门、东山4个海洋观测站、13个观测点，配有先进的海洋水文气象自动观测系统，可开展海浪、潮汐、海温、盐度及风、气压、气温、相对湿度、海面有效能见度、降水量、雾等要素的连续观测。通过构建台站观测数据传输系统、VSAT卫星通信系统、卫星云图遥感接收系统等通信网络，形成了由专线、卫星、互联网络和移动通信组成的海洋观测数据传输网，可实时接收、处理全球水文气象资料、福建沿海海洋站观测资料、东海和台湾海峡浮标资料、台湾岛周边的水文气象资料、地波雷达资料和气象卫星遥感资料。
    目前，预报台已拥有近五十年的海洋水文、气象等资料，这些资料在地方海洋经济建设、防灾减灾和国防军事等方面发挥了积极的作用。